40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3527 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  100 
 
 		 377 aa  754    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  48.81 
 
 		 366 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  51.17 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  44.8 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  35.76 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  27.67 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  28.9 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  27.4 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  28.78 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  27.12 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  27.64 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  26.85 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  25.74 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  26.2 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  28.7 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  27.19 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.36 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  28.02 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  25.52 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  24.78 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  27.3 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  27.73 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  23.12 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  24.15 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  23.21 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  22.26 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  22.87 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  24.8 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  21.43 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  27.5 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>