45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4941 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  100 
 
 		 354 aa  710    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  98.31 
 
 		 354 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  74.65 
 
 		 354 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  73.8 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  73.8 
 
 		 354 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  74.08 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  72.96 
 
 		 354 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  73.8 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  73.52 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  63.28 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  61.13 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  32.67 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  30.03 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  33 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  32.89 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  29.49 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  27.61 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  29.18 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  31.29 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  26.2 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  27.11 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  27.52 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  27.03 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  25.98 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  27.03 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  25.57 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  27.98 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  25.57 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  27.98 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  27.08 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  26.99 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  22.64 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  29.29 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  22.9 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.16 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  22.63 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  26.07 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  26.32 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  21.7 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  21.15 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  23.51 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  21.21 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  27.05 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  21.32 
 
 		 383 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>