49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0811 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  100 
 
 		 387 aa  783    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  76.82 
 
 		 387 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  74.09 
 
 		 384 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  75.06 
 
 		 381 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  78.81 
 
 		 386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  78.81 
 
 		 386 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 383 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  69.61 
 
 		 382 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  60.81 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  27.42 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  30.41 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.56 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  29.69 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  24.51 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  25.07 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  25.31 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  21.75 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  23.65 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  21.75 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  23.75 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  28.93 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.81 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  23.08 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  23.17 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  19.29 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  24.29 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  22.7 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  22.61 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  23.33 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  29.01 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  24.59 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  21.99 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  21.48 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  21.3 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  21.75 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.71 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  24.12 
 
 		 435 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  19.94 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  21.43 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  30.69 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  23.42 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  21.37 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  23.66 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  29.7 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.89 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  21.26 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  22.61 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  19.94 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>