59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0937 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  100 
 
 
386 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  99.48 
 
 
386 aa  781    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  77.92 
 
 
387 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  78.81 
 
 
387 aa  587  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  74.41 
 
 
381 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  72.82 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  68.93 
 
 
382 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  71.2 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  60.27 
 
 
381 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  30.97 
 
 
425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  28.17 
 
 
356 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.34 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  30.51 
 
 
368 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  24.88 
 
 
410 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  24.86 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  25.63 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  22.94 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  26.79 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  22.94 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  25.15 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  22.99 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  24.61 
 
 
435 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  24.23 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  25.28 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  25.13 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  22.14 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  22.56 
 
 
426 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  23.22 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  21.13 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  22.65 
 
 
441 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  22.81 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  18.91 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  20.38 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  22.02 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  24.82 
 
 
379 aa  53.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  21.34 
 
 
431 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.66 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  21.96 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  29.27 
 
 
344 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  27.27 
 
 
384 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  21.63 
 
 
417 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  23.3 
 
 
452 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  23.51 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  22.69 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  22.88 
 
 
475 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  22.78 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  20.95 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  21.49 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  21.41 
 
 
420 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  21.3 
 
 
443 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  23.04 
 
 
377 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  21.3 
 
 
444 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  20.95 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  20.99 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  20.95 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  21.49 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  20.63 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  20.92 
 
 
422 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  21.19 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>