32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0825 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  722    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  27.97 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  25.56 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  25 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  24.21 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.96 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  24.58 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  25.09 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  23.79 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  28.1 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  24.52 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  24.52 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.52 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  35.63 
 
 
431 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  28.86 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  25.08 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  28.47 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  32.18 
 
 
475 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  28.74 
 
 
444 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  28.74 
 
 
443 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  31.03 
 
 
446 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  31.3 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  36.36 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  23.86 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  25.5 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  26.76 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  28.74 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  27.35 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  28.74 
 
 
441 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  28.74 
 
 
422 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.68 
 
 
458 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>