23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4530 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  100 
 
 		 384 aa  788    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  55.68 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  39.94 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  31.32 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  29.95 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  25.06 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  31.32 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  29.38 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  22.54 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  21.85 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  23.84 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  21.33 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  26.99 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  26.35 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.49 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  22.48 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  23.58 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  22.22 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>