37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4576 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  95.36 
 
 		 366 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  48.81 
 
 		 377 aa  351  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  49.46 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  32.85 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  25.3 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.03 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  25.3 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  25.74 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  25.68 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  26.22 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  26.44 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  28.12 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  22.94 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  28.02 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  25.23 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  24.85 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  28.18 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  24.77 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  28.31 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  24.52 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  26.81 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  26.54 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  22.36 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  24.02 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  24.11 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  23.51 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  22.54 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  25.22 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 382 aa  52.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  25.45 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  19.87 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.41 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  25.11 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>