More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3619 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3619  ExsB family protein  100 
 
 		 320 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1254  ExsB family protein  76.56 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2680  ExsB family protein  66.14 
 
 		 322 aa  454  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  44.3 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  44.84 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  41.27 
 
 		 510 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  38.73 
 
 		 507 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  40.95 
 
 		 512 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  42.9 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  37.58 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  42.39 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  42.17 
 
 		 505 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  42.9 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  42.9 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  43.85 
 
 		 512 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  42.41 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  42.49 
 
 		 513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  36.94 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  40.38 
 
 		 505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16720  GMP synthase, glutamine-hydrolyzing, C-terminal domain or B subunit  41.32 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  39.87 
 
 		 517 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  40.89 
 
 		 510 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  39.57 
 
 		 505 aa  210  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  40.37 
 
 		 511 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  37.18 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  39.94 
 
 		 509 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  38.8 
 
 		 512 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.62 
 
 		 511 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  38.49 
 
 		 512 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  38.61 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.85 
 
 		 510 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  39.26 
 
 		 575 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  39.62 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  38.65 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  36.22 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  40.74 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  39.43 
 
 		 531 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  36.22 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  41.08 
 
 		 516 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  41.53 
 
 		 517 aa  205  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  38.24 
 
 		 528 aa  205  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  39.68 
 
 		 501 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  39.68 
 
 		 501 aa  205  9e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  41.75 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  38.84 
 
 		 528 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  37.58 
 
 		 529 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  41.03 
 
 		 506 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  38.1 
 
 		 510 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  40.44 
 
 		 518 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  39.81 
 
 		 510 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  38.91 
 
 		 515 aa  202  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  38.96 
 
 		 528 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  41.04 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  38.73 
 
 		 520 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  40.06 
 
 		 516 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  38.65 
 
 		 575 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  38.1 
 
 		 512 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  40.32 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  37.89 
 
 		 510 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  38.41 
 
 		 511 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  38.96 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  37.27 
 
 		 516 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  38.96 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  36.83 
 
 		 513 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  38.17 
 
 		 516 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  38.17 
 
 		 516 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  37.61 
 
 		 528 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  41.61 
 
 		 533 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  37.97 
 
 		 515 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  37.85 
 
 		 516 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  40.75 
 
 		 510 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  41.23 
 
 		 528 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  38.18 
 
 		 520 aa  199  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  39.38 
 
 		 522 aa  199  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  36.45 
 
 		 508 aa  198  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  37.26 
 
 		 511 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  40.13 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  37.26 
 
 		 520 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  38.92 
 
 		 515 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  39.24 
 
 		 515 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  37.42 
 
 		 540 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  39.24 
 
 		 514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  38.96 
 
 		 540 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  39.24 
 
 		 514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  35.94 
 
 		 507 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  35.29 
 
 		 507 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  37.85 
 
 		 533 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  38.17 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  41.51 
 
 		 522 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  41.49 
 
 		 515 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  36.17 
 
 		 528 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>