141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2927 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2927  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.612838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2553  putative nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.91 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  26.05 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.46 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  26 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.38 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  23.2 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  24.24 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  23.7 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 331 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  22.27 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  25.74 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  29.12 
 
 		 403 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  25.77 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1897  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  24.15 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3790  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.84 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  23.95 
 
 		 331 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  24.6 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.87 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  27 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.48 
 
 		 357 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1151  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.29 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1563  nucleotidyl transferase  22.71 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.53 
 
 		 354 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3094  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.56 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  26.1 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2192  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.44 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00604297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  26.1 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  23.97 
 
 		 399 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  26.14 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.48 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.91 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  29.17 
 
 		 854 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  22.69 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 383 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.2 
 
 		 357 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  24.39 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  26.15 
 
 		 830 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  26.29 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  23.21 
 
 		 476 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  23.18 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  23.01 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  25.1 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0877  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.65 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  23.16 
 
 		 348 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6560  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0782  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  19.62 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.36 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.57 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.35 
 
 		 325 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  27.54 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  26.23 
 
 		 365 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2260  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  21.63 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  26.64 
 
 		 336 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  24.08 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  26.58 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  26.58 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.44 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.41 
 
 		 354 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.34 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  24.64 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0131  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  20.85 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.86 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.98 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.98 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  22.31 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.98 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.8 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  25.22 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  28.34 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  25.64 
 
 		 836 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  27.41 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  19.55 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1423  hypothetical protein  23.92 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  26.42 
 
 		 828 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  24.39 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  25.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.24 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  23.59 
 
 		 836 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2156  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.12 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0607  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.94 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.7356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.8 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.9 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.52 
 
 		 357 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  24.3 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.24 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2384  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.08 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  19.77 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>