96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0308 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  73.93 
 
 		 241 aa  348  4e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  72.15 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  54.43 
 
 		 494 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  51.04 
 
 		 504 aa  275  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  42.11 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  40.08 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  34.43 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  32.55 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  32.11 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.83 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  28.64 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  31.36 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  26.61 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  27.94 
 
 		 548 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  28.8 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  28.74 
 
 		 529 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  28.97 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  29.57 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  25.83 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  23.89 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  26.59 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  28.16 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  28.16 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  25.65 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  25.74 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 331 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 329 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.26 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  25.75 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  25.82 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  24.17 
 
 		 326 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.11 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.41 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.4 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  25.84 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  24.55 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.21 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  23.18 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  26.44 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2927  nucleotidyl transferase  23.7 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.612838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.9 
 
 		 493 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.23 
 
 		 411 aa  49.3  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.18 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  29.11 
 
 		 403 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  25.94 
 
 		 411 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  26.15 
 
 		 381 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2473  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.62 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.63 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  23.3 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  24.86 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  24.45 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  23.16 
 
 		 392 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.12 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.1 
 
 		 355 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0782  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.15 
 
 		 355 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  25.14 
 
 		 392 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  22.89 
 
 		 326 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.73 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0186  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.53 
 
 		 454 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.53 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  24.32 
 
 		 835 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  28.48 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.29 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1132  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.83 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  26.86 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  21.13 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  25.58 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  22.69 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  24.72 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  23.63 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  23.63 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 414 aa  43.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.62 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  23.76 
 
 		 370 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.31 
 
 		 376 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.82 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  23.37 
 
 		 399 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  22.57 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.29 
 
 		 357 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  23.08 
 
 		 392 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1159  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.12 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000567806  decreased coverage  0.00280278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.37 
 
 		 828 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  21.62 
 
 		 236 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  25.95 
 
 		 360 aa  42  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  24.72 
 
 		 296 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  24.04 
 
 		 359 aa  42  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>