81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0349 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  42.32 
 
 		 504 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.93 
 
 		 494 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  43.51 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  40 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  34.62 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  31.74 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  34.43 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  31.3 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  32.11 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  27.56 
 
 		 548 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  31.11 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  26.29 
 
 		 529 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  25.22 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  24.26 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  24.58 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  25.55 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  25.11 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  25.11 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  22.41 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  26.32 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  21.07 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.11 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  23.39 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  27.94 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  24.88 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.26 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.18 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.46 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.21 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.07 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  22.73 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.66 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  22.43 
 
 		 331 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  21.59 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.22 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.47 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.81 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  24.86 
 
 		 357 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.62 
 
 		 353 aa  48.9  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.6 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  23.92 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  21.5 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  22.38 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2927  nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.612838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  21.25 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  24.19 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  22.07 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  26.07 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  25.21 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  22.17 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  25.82 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.79 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1663  Nucleotidyl transferase  23.6 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.32 
 
 		 493 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  22.22 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.49 
 
 		 453 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  24.58 
 
 		 399 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  23.16 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  23.38 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.86 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  21.27 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  25.59 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  21.27 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.76 
 
 		 356 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  26.61 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  26.61 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  23.11 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0378  Nucleotidyl transferase  22.44 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0925402 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  22.08 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2056  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.81 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2772  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23 
 
 		 456 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.32493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  32.99 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.23 
 
 		 286 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>