32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2553 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2553  putative nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2927  nucleotidyl transferase  36.91 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.612838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  23.24 
 
 		 357 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  25.1 
 
 		 359 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0722  nucleotidyl transferase  23.89 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.94 
 
 		 590 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  24.4 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  23.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.22 
 
 		 405 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1259  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  24.27 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  40.38 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  22.07 
 
 		 397 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  31.25 
 
 		 381 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  22.18 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  23.19 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  24.17 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  30.91 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  24.46 
 
 		 619 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 596 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  21.24 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  23.46 
 
 		 359 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  21.81 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  21.49 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01391  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  19.05 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 504 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  21.81 
 
 		 842 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  34.72 
 
 		 255 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.04 
 
 		 370 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  22.22 
 
 		 412 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.93 
 
 		 333 aa  41.6  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0216  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  27.69 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.800339  normal  0.261053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>