186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0005 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0005  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 609 aa  1234    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.795946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  25.67 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1537  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  43.37 
 
 		 621 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  42.17 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  42.17 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  36.67 
 
 		 619 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  26.82 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0267  heat shock protein HtpX  27.27 
 
 		 291 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  32.61 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  41.46 
 
 		 677 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  26.79 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1447  heat shock protein HtpX  28.37 
 
 		 291 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  24.8 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  32.19 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  27.56 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0293  heat shock protein HtpX  26.8 
 
 		 292 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.985067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  39.51 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  36.11 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2395  heat shock protein HtpX  29.86 
 
 		 303 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0566  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 669 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0549  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 669 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 860 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 		 285 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 883 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0890  peptidase M48 Ste24p  38.27 
 
 		 396 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  23.98 
 
 		 420 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 579 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  28.03 
 
 		 297 aa  50.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  30.94 
 
 		 287 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  25 
 
 		 392 aa  50.4  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  27.92 
 
 		 318 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 576 aa  50.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1205  peptidase, M48 family  24.81 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3307  heat shock protein HtpX  25 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  30.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0820  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  30.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  30 
 
 		 283 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  25.41 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3515  Ste24 endopeptidase  27.19 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  30.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 		 284 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  24.56 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1059  heat shock protein HtpX  26.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.548396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 		 610 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1074  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 657 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.959288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  23.37 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  25.98 
 
 		 435 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1580  heat shock protein HtpX  26.24 
 
 		 291 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.36 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 610 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5219  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 676 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0606232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  34.26 
 
 		 573 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1154  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.997674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 617 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 567 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  26.9 
 
 		 287 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 268 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 296 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  26.62 
 
 		 320 aa  48.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3464  heat shock protein HtpX  25.55 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 572 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.96 
 
 		 557 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  30 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 		 281 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 592 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 566 aa  47.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  22.52 
 
 		 292 aa  47.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 592 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  27.78 
 
 		 290 aa  47.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  27.45 
 
 		 292 aa  47.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  25.63 
 
 		 408 aa  47.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 274 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  27.52 
 
 		 296 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1446  heat shock protein HtpX  24.31 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.501086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  29.14 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 593 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.73 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4386  peptidase M48 Ste24p  25.77 
 
 		 667 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.186622 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 593 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 402 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 886 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  27.32 
 
 		 414 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 		 296 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  26.32 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0986  heat shock protein HtpX  26.72 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.419711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  30.15 
 
 		 279 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1962  heat shock protein HtpX  26.95 
 
 		 291 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.409583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  24.86 
 
 		 419 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1480  heat shock protein HtpX  24.31 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  24.75 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>