250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4606 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4606  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.35086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0336  two component LuxR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1671  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1707  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000162083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1563  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  24.76 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1891  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  27.04 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  27.04 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.8 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  44.83 
 
 		 947 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  25.98 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  27.88 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  26.61 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1531  LuxR family DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000956559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  27.22 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  24.38 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  28.91 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  28.97 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  27.88 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  28.85 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  24.04 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.3 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  24.89 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4209  two component LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  27.83 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.09 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  36.46 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>