198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0336 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0336  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4606  transcriptional regulatory protein  51.55 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.35086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2542  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000537034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1233  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.56 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2051  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.56 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.74459e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2184  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.56 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000916169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3050  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1697  transcriptional regulator, LuxR family  25.56 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2141  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.97 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000944438  normal  0.224442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2728  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.56 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000830515  normal  0.480733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1137  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.97 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192642  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2145  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.97 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000312117  hitchhiker  0.00586911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1259  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.97 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0272351  normal  0.751941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2199  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.97 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.62751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1691  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000265916  hitchhiker  0.00232643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1891  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1072  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  25.14 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000307954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1671  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1563  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1707  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000162083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  28.43 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.09 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  25.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  27.94 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  25.48 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  27.41 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  23.12 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  26.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  26.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  26.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  26.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.08 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  26.9 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  27.67 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  27.83 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  28.57 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  28.16 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.4 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  51.06 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  51.06 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  27.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.83 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  22.93 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  35.82 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.52 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3766  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 539 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484632  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  25.73 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  24.02 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  24.51 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  28.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  26.05 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  26.44 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  23.59 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  23.59 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.45 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  35.59 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  25.89 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 233 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  22.05 
 
 		 264 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  25.89 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>