More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1924 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1377  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  99.38 
 
 
324 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.311563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1924  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  100 
 
 
324 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0499049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2105  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease  100 
 
 
324 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1362  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  99.07 
 
 
324 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1346  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter permease component  99.69 
 
 
324 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3548  nickel ABC transporter permease  69.87 
 
 
322 aa  447  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00865819  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1072  nickel ABC transporter, permease protein  69.87 
 
 
322 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.87 
 
 
322 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0398727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1328  dipeptide ABC transporter, permease protein  53.85 
 
 
359 aa  321  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.97 
 
 
300 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
370 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.5 
 
 
330 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
332 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
327 aa  272  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
331 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
324 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
329 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0188  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1344  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
330 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
327 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
325 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1676  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  40.86 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.96403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.87 
 
 
326 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
340 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
306 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
306 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
327 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
338 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  30.43 
 
 
318 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.43 
 
 
318 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
318 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
306 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 
316 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 
318 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  31.27 
 
 
307 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
307 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 
307 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  31.68 
 
 
318 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  28.34 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  28.34 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
325 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
340 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.31 
 
 
313 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.34 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.11 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
323 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
332 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
313 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
313 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
327 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
323 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
322 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
313 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
333 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  33.91 
 
 
298 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0394  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 
320 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
320 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
327 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.96 
 
 
326 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
328 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
320 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  32.32 
 
 
314 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
324 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
313 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
313 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
318 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
333 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  28.03 
 
 
316 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.09 
 
 
329 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  28.03 
 
 
316 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
318 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  31.94 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
320 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04000  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.53 
 
 
325 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.125723  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3038  oligopeptide ABC transporter, permease  32.4 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
325 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  34.46 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
340 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00450006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
313 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.78 
 
 
313 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
313 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
314 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.926588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
321 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
322 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.68 
 
 
329 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
340 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
325 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
313 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.11 
 
 
317 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>