More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1072 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1072  nickel ABC transporter, permease protein  100 
 
 
322 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494547  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3548  nickel ABC transporter permease  100 
 
 
322 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00865819  normal  0.0646606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0398727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2105  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease  70.2 
 
 
324 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1346  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter permease component  70.2 
 
 
324 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1924  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  70.2 
 
 
324 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0499049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1362  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  69.87 
 
 
324 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1377  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  69.87 
 
 
324 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.311563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1328  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.43 
 
 
370 aa  305  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.59 
 
 
300 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.465454  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.78 
 
 
330 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.68 
 
 
331 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
327 aa  277  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
329 aa  271  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
327 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1344  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.17 
 
 
330 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
324 aa  260  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0188  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
325 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
325 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0122528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1676  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease component  41.44 
 
 
330 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.96403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  33.44 
 
 
307 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
306 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
320 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
306 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
307 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4328  putative ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 
325 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
311 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
325 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  33.88 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0648374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.23 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.07 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.11 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  33.55 
 
 
306 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  33.55 
 
 
306 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  30.74 
 
 
316 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
340 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
316 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 
316 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
334 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
306 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 
318 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  31.89 
 
 
318 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  30.79 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  33.55 
 
 
306 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.89 
 
 
318 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 
306 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
311 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
327 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.77 
 
 
325 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
306 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  33.68 
 
 
313 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
306 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.92 
 
 
306 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  31.77 
 
 
307 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
307 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  31.92 
 
 
306 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
313 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.57 
 
 
306 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
332 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  33.44 
 
 
327 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.11 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.92 
 
 
340 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
306 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
318 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
314 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 
327 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
328 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
318 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532863  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  30.1 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.1 
 
 
316 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
333 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
306 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.6 
 
 
306 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
306 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  33.11 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
318 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
324 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>