More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3038 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3038  oligopeptide ABC transporter, permease  100 
 
 
340 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  75.54 
 
 
329 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  38.32 
 
 
316 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  38.01 
 
 
316 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
316 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
316 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  37.69 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.69 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
321 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 
321 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
321 aa  222  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
324 aa  222  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
321 aa  222  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04000  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.1 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.125723  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
328 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
321 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
325 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
321 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  38.23 
 
 
324 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
326 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.34 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
321 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  35.39 
 
 
307 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  35.39 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.39 
 
 
318 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
307 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
319 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 
318 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.98 
 
 
340 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
318 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
331 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
319 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
307 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
322 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
325 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  33.97 
 
 
318 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
313 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
338 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
318 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.22 
 
 
313 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
313 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  35.52 
 
 
336 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
318 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
332 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
327 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
320 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
340 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
320 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.48 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
313 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
364 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
305 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
344 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
322 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
309 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
324 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
325 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
319 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
321 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
343 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
319 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
331 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1344  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
330 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
306 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
323 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.54 
 
 
321 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
339 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.88 
 
 
326 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
335 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
327 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
315 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
314 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
343 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
326 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
308 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
320 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
336 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
306 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
306 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.59 
 
 
326 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
334 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>