29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0783 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.428854  normal  0.284641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.48 
 
 		 739 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3455  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 		 4104 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 739 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3311  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 4074 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 533 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 581 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 354 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 594 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  33.93 
 
 		 642 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 414 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  26.86 
 
 		 566 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 502 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1098  type II and III secretion system protein  23.96 
 
 		 907 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  hitchhiker  0.000681519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 502 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 1459 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 502 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 568 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  33.04 
 
 		 645 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  25.93 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 450 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 583 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 886 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 645 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 739 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 2240 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>