21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5690 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  48.74 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  24.88 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  22.58 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  36.19 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  29.49 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  29.86 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 750 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  27.07 
 
 		 992 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  35.63 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 361 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63917  Anaphase promoting complex subunit CDC27 (Cell division control protein 27) (Anaphase promoting complex subunit 3)  25 
 
 		 571 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.66 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 548 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 222 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 265 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>