14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4013 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  37.78 
 
 		 279 aa  95.5  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  41.18 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  42.75 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  24.88 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  25.63 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.24 
 
 		 875 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.43 
 
 		 462 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25 
 
 		 884 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  34.52 
 
 		 358 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>