22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1574 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  72.2 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  55.14 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  55.71 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  36.72 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  35.63 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  32.2 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 468 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1421 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.01 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.06 
 
 		 884 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  32.56 
 
 		 767 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  38.6 
 
 		 643 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  34.33 
 
 		 595 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 693 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  40.35 
 
 		 587 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  40.98 
 
 		 609 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>