13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4098 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  48.74 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  25.63 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  25.46 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  33.72 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  31.63 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 626 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 750 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 		 220 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 626 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  24.62 
 
 		 626 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>