23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3153 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  82.49 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  52.36 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  51.12 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  33.93 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  28.4 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  32.46 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  33.72 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  40.4 
 
 		 1677 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 594 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1276 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 3035 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1956  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1421 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 468 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 1979 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 503 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 716 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.71 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 632 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 629 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>