19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2326 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2326  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.343306  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3153  tetratricopeptide TPR_2  83.81 
 
 		 251 aa  340  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1574  hypothetical protein  52.19 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1393  hypothetical protein  52.47 
 
 		 279 aa  205  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4013  hypothetical protein  34.16 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5690  Tetratricopeptide repeat protein  36.19 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  34.07 
 
 		 1677 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4098  hypothetical protein  31.63 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.76681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1587  hypothetical protein  31.03 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0334262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1421 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 594 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  31.62 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 503 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  32.43 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 468 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.32 
 
 		 708 aa  41.6  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>