More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4012 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 301 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  99 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  99 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  98.01 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  95.35 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  93.69 
 
 		 301 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  93.02 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  93.36 
 
 		 301 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  93.02 
 
 		 301 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  85.05 
 
 		 301 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  82.39 
 
 		 301 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  81 
 
 		 302 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  80.33 
 
 		 302 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  81 
 
 		 301 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  78.07 
 
 		 301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  80.07 
 
 		 301 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  47.74 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 		 323 aa  281  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.52 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 		 309 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.38 
 
 		 316 aa  254  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.38 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  44.08 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 315 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  39.87 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.94 
 
 		 312 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  44.15 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  42.95 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.11 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  44.11 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  39.6 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  41.64 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  44.11 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  42.67 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  44.56 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  44.15 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  43.39 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  42.14 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  42.05 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  38.33 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  40.94 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  42.52 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  43.3 
 
 		 330 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  41.98 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  41.69 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0397  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0463662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  38.03 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  39 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  43.58 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  40.54 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  43.67 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 		 313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  42.11 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  40.26 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>