More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1380 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 338 aa  696    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  82.87 
 
 		 334 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  82.62 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  79.75 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  79.82 
 
 		 330 aa  552  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  76.83 
 
 		 344 aa  538  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  72.84 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 		 312 aa  325  8.000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 		 303 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 312 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 303 aa  292  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  47.1 
 
 		 313 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 		 303 aa  285  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.77 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  47.63 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  51.11 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  46.97 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 		 303 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.86 
 
 		 307 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  44.9 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.27 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.35 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.96 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.34 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.34 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.2 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.34 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 		 313 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.17 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 309 aa  272  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.12 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.03 
 
 		 316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  43.37 
 
 		 304 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  44.85 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  49.82 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 317 aa  265  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 329 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  45.66 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  46.74 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  41.61 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  42.99 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  44.24 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 		 300 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  43.52 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  43.97 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  44.13 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  45.6 
 
 		 310 aa  259  7e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  44.9 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  43.95 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.24 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  43.49 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 		 305 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>