More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1869 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 307 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  77.7 
 
 		 305 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  66.45 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  64.45 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  63.76 
 
 		 320 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 		 308 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  59.27 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  58.28 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  59.74 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  59.47 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 303 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  56.72 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  58.94 
 
 		 309 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 		 306 aa  361  9e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  55.74 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 		 312 aa  355  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  54.64 
 
 		 302 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  56.77 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 		 309 aa  348  9e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 304 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 		 316 aa  345  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 		 313 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 		 312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 316 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  52.83 
 
 		 317 aa  334  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  54.67 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 		 302 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 		 306 aa  332  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 323 aa  330  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 305 aa  329  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 309 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 		 305 aa  321  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  50.96 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  50.96 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  52.12 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 306 aa  315  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 309 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 307 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 304 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 312 aa  311  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 303 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  52.26 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>