More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2080 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
298 aa  618  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  69.83 
 
 
304 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  68.77 
 
 
304 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  70.43 
 
 
300 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  67.56 
 
 
301 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  67.44 
 
 
303 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  64.21 
 
 
302 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 
303 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  65.89 
 
 
305 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  65.89 
 
 
305 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  63.21 
 
 
306 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 
306 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  62.88 
 
 
306 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 
306 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 
306 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  62.88 
 
 
306 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  63.21 
 
 
307 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  61.2 
 
 
308 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 
306 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 
306 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  65.54 
 
 
300 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 
304 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  60.54 
 
 
307 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  61 
 
 
305 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  62.33 
 
 
311 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  62.33 
 
 
311 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 
312 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  60.27 
 
 
305 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
308 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  57.81 
 
 
305 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  57.81 
 
 
305 aa  360  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
309 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
309 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
309 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
329 aa  358  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  58.59 
 
 
309 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  57.91 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  58.25 
 
 
560 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 
329 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 
326 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 
309 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 
321 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  56.23 
 
 
311 aa  352  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
306 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 
306 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  56.81 
 
 
310 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 
326 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 
306 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  54.29 
 
 
320 aa  348  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 
307 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  56.9 
 
 
307 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 
309 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  55.22 
 
 
302 aa  341  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  55.22 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 
308 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.25 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
303 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  53.65 
 
 
320 aa  331  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
316 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
303 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
328 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 
305 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
309 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
314 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 
303 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
311 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  52.33 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 
312 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  52.77 
 
 
304 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
308 aa  316  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 
319 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
303 aa  315  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
312 aa  315  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
331 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 
304 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>