More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2554 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 308 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  96.75 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  96.43 
 
 		 308 aa  630  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  85.57 
 
 		 307 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  85.2 
 
 		 307 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  80.13 
 
 		 309 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  80.13 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  78.62 
 
 		 326 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  79.73 
 
 		 309 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  77.96 
 
 		 326 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  78.41 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  78.41 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  79.07 
 
 		 309 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  78.41 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  78.41 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  78.41 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  77.74 
 
 		 309 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  77.41 
 
 		 560 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  72.31 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  71.38 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.43 
 
 		 305 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  71.43 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  68.87 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  69.93 
 
 		 309 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  71.1 
 
 		 306 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  70.43 
 
 		 302 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  69.97 
 
 		 308 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  70.16 
 
 		 305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  68.69 
 
 		 320 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  70.16 
 
 		 305 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  68.44 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  68.75 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  65.56 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 		 300 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  56.52 
 
 		 300 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 		 304 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  55.18 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.04 
 
 		 301 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  54.82 
 
 		 303 aa  340  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 		 298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.35 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  52.68 
 
 		 305 aa  335  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  52.35 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  52.01 
 
 		 307 aa  332  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  53.2 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 		 304 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 303 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 305 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.02 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 306 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  51.85 
 
 		 308 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 302 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 313 aa  288  8e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 		 330 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>