More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0343 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
315 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  67.32 
 
 
312 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  61.11 
 
 
320 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 
307 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 
312 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  57.74 
 
 
309 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  58.31 
 
 
314 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  60.54 
 
 
306 aa  378  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
313 aa  374  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  58.76 
 
 
305 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 
355 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 
305 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  58.75 
 
 
303 aa  364  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  61.24 
 
 
312 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
303 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 
303 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
303 aa  359  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
303 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 
309 aa  353  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 
301 aa  352  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 
313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
305 aa  351  8e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
302 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  57.28 
 
 
304 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
316 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
302 aa  350  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
303 aa  349  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
316 aa  348  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
316 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
316 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  57.48 
 
 
323 aa  348  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
316 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
316 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
305 aa  346  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
316 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
316 aa  345  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
302 aa  345  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
303 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
316 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 
312 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
308 aa  338  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  51.79 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
309 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
313 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  329  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
302 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
321 aa  326  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 
340 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  54.84 
 
 
312 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
306 aa  324  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
303 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
315 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
309 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
311 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.4 
 
 
311 aa  322  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
302 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 
317 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
313 aa  321  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  51.46 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
323 aa  319  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 
306 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  53.55 
 
 
312 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  53.59 
 
 
305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
312 aa  318  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
323 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
304 aa  317  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 
308 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  50.8 
 
 
317 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
309 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  51.94 
 
 
307 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
307 aa  314  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>