More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1163 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  85.62 
 
 
329 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  84.26 
 
 
311 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  84.44 
 
 
302 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  82.62 
 
 
309 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  82.22 
 
 
320 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  86.18 
 
 
310 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  84.31 
 
 
305 aa  547  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  84.31 
 
 
305 aa  547  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  84.64 
 
 
306 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  81.27 
 
 
320 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  75.83 
 
 
305 aa  501  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  75 
 
 
308 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  73.18 
 
 
306 aa  491  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  72.31 
 
 
308 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  72.31 
 
 
308 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
309 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  72.85 
 
 
306 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  70.86 
 
 
309 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  70.53 
 
 
309 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  70.53 
 
 
309 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  70.53 
 
 
309 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
309 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  69.87 
 
 
309 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  69.87 
 
 
309 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  72.31 
 
 
308 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
309 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  70.96 
 
 
307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  69.54 
 
 
560 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  70.2 
 
 
329 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  67.75 
 
 
326 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  69.51 
 
 
307 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  67.43 
 
 
326 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  59.4 
 
 
300 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  58 
 
 
303 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
300 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 
304 aa  359  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 
321 aa  355  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 
304 aa  355  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 
298 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
311 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
311 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 
302 aa  351  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 
301 aa  343  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 
305 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 
303 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  54.21 
 
 
306 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 
305 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 
306 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 
305 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
307 aa  335  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 
303 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 
306 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 
306 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  53.2 
 
 
306 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
304 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 
307 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 
303 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
306 aa  331  8e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
305 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  52.35 
 
 
306 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 
303 aa  328  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
305 aa  328  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 
303 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
303 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
305 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 
308 aa  324  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
302 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
307 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
315 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
311 aa  311  7.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
308 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
300 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
303 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
314 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
312 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
312 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
308 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
309 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
308 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
312 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 
305 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
319 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>