More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0907 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
320 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  86.56 
 
 
320 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  82.22 
 
 
309 aa  549  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  80.45 
 
 
329 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  80.13 
 
 
302 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  77.88 
 
 
311 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  77.56 
 
 
309 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  79.05 
 
 
305 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  79.05 
 
 
305 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  77.85 
 
 
306 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  77.29 
 
 
310 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  71.25 
 
 
305 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  71.47 
 
 
306 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  69.75 
 
 
308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  70.19 
 
 
306 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  67.73 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  68.37 
 
 
309 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  68.59 
 
 
309 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  67.09 
 
 
309 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  67.09 
 
 
309 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  67.73 
 
 
309 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  68.27 
 
 
309 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  68.27 
 
 
309 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  68.27 
 
 
309 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  68.69 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  67.31 
 
 
309 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  67.63 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  67.85 
 
 
307 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  67.31 
 
 
560 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  67.3 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  67.3 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  66.03 
 
 
329 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
307 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  64.35 
 
 
326 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  63.72 
 
 
326 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
300 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
303 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  54.22 
 
 
304 aa  352  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  56.01 
 
 
304 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  54.29 
 
 
298 aa  348  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 
300 aa  347  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.61 
 
 
321 aa  346  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  55.31 
 
 
311 aa  341  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  55.31 
 
 
311 aa  341  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  50.96 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  54.4 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
307 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
302 aa  332  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  51.6 
 
 
312 aa  330  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  52.08 
 
 
303 aa  328  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 
305 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
304 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
305 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 
305 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 
306 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
306 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
307 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
305 aa  322  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
303 aa  318  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
308 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.48 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
306 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  48.41 
 
 
305 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
303 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
303 aa  305  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 
307 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 
300 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
309 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  48.57 
 
 
311 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.92 
 
 
315 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
309 aa  298  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 
302 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 
312 aa  297  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.59 
 
 
303 aa  295  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 
355 aa  295  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  50.32 
 
 
309 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  48.56 
 
 
308 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
298 aa  291  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
312 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
305 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
300 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 
308 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
300 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>