More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1850 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
305 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  84.21 
 
 
308 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  82.18 
 
 
306 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  78.55 
 
 
306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  75.83 
 
 
309 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  77.3 
 
 
329 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  73.6 
 
 
329 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  74.17 
 
 
302 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  71.85 
 
 
311 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  73.23 
 
 
305 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  73.23 
 
 
305 aa  481  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  71.25 
 
 
320 aa  477  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  72.52 
 
 
309 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  71.25 
 
 
320 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  71.95 
 
 
326 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  71.52 
 
 
309 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  71.85 
 
 
309 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  71.95 
 
 
309 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  71.29 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  71.43 
 
 
308 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  71.99 
 
 
309 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  72.04 
 
 
310 aa  464  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  71.1 
 
 
307 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  70.63 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  71.29 
 
 
309 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  71.76 
 
 
307 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  70.63 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  70.63 
 
 
309 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  71.19 
 
 
309 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  71.8 
 
 
306 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  70.3 
 
 
560 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  70.76 
 
 
308 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  70.76 
 
 
308 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  69.97 
 
 
309 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  60.27 
 
 
298 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 
304 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  58.33 
 
 
303 aa  363  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  59 
 
 
300 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 
302 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 
300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  60.4 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
303 aa  352  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 
311 aa  351  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 
311 aa  351  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  57.24 
 
 
301 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  56.35 
 
 
321 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 
306 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 
306 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  55.22 
 
 
307 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  55.7 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 
306 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  55.7 
 
 
305 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
306 aa  340  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 
306 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  54.3 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 
306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 
306 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
305 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
305 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  53.69 
 
 
306 aa  329  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
303 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
302 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
303 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
308 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
311 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
308 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
307 aa  295  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
308 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
316 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
323 aa  292  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
314 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
309 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 
309 aa  288  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
308 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
314 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
319 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
328 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
311 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>