More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1079 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  99.35 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  98.04 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  94.12 
 
 		 306 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  85.29 
 
 		 307 aa  544  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  83.33 
 
 		 306 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  80.72 
 
 		 306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  80.72 
 
 		 306 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  78.43 
 
 		 308 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  78.62 
 
 		 305 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  77.96 
 
 		 305 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 303 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  68.23 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  62.67 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  63.33 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  64.55 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 		 305 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  63 
 
 		 305 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  64.88 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  60.6 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  64.98 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  62.5 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  59.67 
 
 		 304 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  54.67 
 
 		 329 aa  338  8e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 		 306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 308 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  53.87 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  54.55 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  54.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  53.51 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 309 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 309 aa  324  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  53.54 
 
 		 560 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 310 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  51.52 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 		 307 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 308 aa  318  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 303 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 309 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 		 302 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 303 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 302 aa  300  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 303 aa  298  9e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>