More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1232 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
311 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  61.11 
 
 
311 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 
309 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  57.01 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  56.45 
 
 
316 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 
313 aa  348  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  56.09 
 
 
308 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
302 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  56.63 
 
 
308 aa  345  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
308 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  55.16 
 
 
328 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
308 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 
317 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  55.66 
 
 
308 aa  338  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 
309 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  54.25 
 
 
303 aa  338  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
314 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
312 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  55.63 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  54.34 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
308 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  55.19 
 
 
307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  55.19 
 
 
304 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  54.17 
 
 
305 aa  333  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 
308 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 
304 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 
326 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
331 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
308 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
313 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
316 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
330 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
298 aa  322  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  53.4 
 
 
308 aa  318  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
316 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
310 aa  316  3e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  53.31 
 
 
300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
304 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  51.29 
 
 
303 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
306 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  54.17 
 
 
305 aa  301  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
311 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
311 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
306 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  55.77 
 
 
306 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
309 aa  298  8e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
308 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
301 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
307 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  54.62 
 
 
305 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  54.05 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
303 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  54.2 
 
 
306 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
306 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
304 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
301 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 
305 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.58 
 
 
305 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  55.17 
 
 
303 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.06 
 
 
305 aa  291  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
306 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
309 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
309 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
304 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
312 aa  289  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
307 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
303 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
355 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
305 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
305 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 
309 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  51.13 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
307 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
302 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
307 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  52.47 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  52.47 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
560 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>