More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1358 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 		 311 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  67.97 
 
 		 309 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  55.19 
 
 		 311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  55.88 
 
 		 312 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 		 308 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  55.05 
 
 		 304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  55.05 
 
 		 304 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  57.38 
 
 		 308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  55.84 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 		 303 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  52.61 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 316 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 317 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 314 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 298 aa  305  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 		 316 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.46 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 307 aa  291  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  49.52 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  52.55 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 		 326 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 303 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  54.89 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 		 305 aa  279  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 		 316 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.1 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 		 306 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.57 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.05 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 		 307 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>