More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0008 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  77.52 
 
 		 312 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  76.17 
 
 		 312 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  76.17 
 
 		 312 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  74.75 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  73.58 
 
 		 304 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  72.91 
 
 		 304 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  71.24 
 
 		 305 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  68.79 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  65.78 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  65.67 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  64.67 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  64.57 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  65.33 
 
 		 316 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  63.42 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  63.4 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  63.91 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  63.79 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 		 317 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  62.25 
 
 		 316 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  62.25 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  61.92 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 326 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 308 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  58.69 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  58.67 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.55 
 
 		 308 aa  358  6e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.63 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 331 aa  345  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 312 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  52.61 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.06 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 316 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 		 303 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  52.05 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 316 aa  311  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.17 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 312 aa  310  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  50.34 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 306 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 		 307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.66 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.82 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 309 aa  298  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  52.17 
 
 		 298 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 313 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.15 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 		 302 aa  288  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>