More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0666 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 308 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  81.17 
 
 		 308 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  80.84 
 
 		 308 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  82.14 
 
 		 308 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  80.52 
 
 		 328 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  78.9 
 
 		 308 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  75.16 
 
 		 308 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  60.53 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  61.97 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  62.3 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  60.46 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 		 314 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  59.67 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 316 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  58.5 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 310 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  56.21 
 
 		 313 aa  358  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  55.05 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 309 aa  351  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 		 311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  53.44 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  305  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 302 aa  300  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 315 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 		 311 aa  289  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  49.32 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 355 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 		 307 aa  279  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 312 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  43.81 
 
 		 305 aa  279  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.34 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>