More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2915 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
305 aa  631  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  77.7 
 
 
307 aa  520  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  64.36 
 
 
315 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  59.41 
 
 
320 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
308 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
355 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  57.76 
 
 
313 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  58.88 
 
 
314 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
309 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
312 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
305 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 
312 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  57.43 
 
 
316 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
316 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 
306 aa  352  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
303 aa  351  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
303 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
303 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 
301 aa  349  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
316 aa  349  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 
316 aa  348  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
316 aa  348  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
302 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
305 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
316 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
316 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
316 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
316 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
303 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.44 
 
 
312 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
316 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
316 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
313 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 
309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
303 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 
312 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 
312 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
323 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
300 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  332  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
309 aa  330  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
321 aa  329  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
306 aa  329  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
317 aa  329  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  328  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  325  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
305 aa  324  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
304 aa  324  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
304 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
304 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 
313 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.87 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
303 aa  319  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
306 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
308 aa  318  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  51.49 
 
 
304 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
305 aa  318  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
309 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1697  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
306 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
302 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  49.05 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
311 aa  312  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
304 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 
305 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
303 aa  310  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
304 aa  310  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
307 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  54.48 
 
 
309 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
307 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
301 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
315 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
307 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
313 aa  309  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
302 aa  308  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3190  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
312 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
298 aa  308  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
308 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
305 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
340 aa  305  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>