More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3171 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 340 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  83.86 
 
 		 317 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  60.46 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 		 315 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  57.28 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  62.42 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 		 307 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  59.61 
 
 		 307 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  59.61 
 
 		 307 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 310 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  54.34 
 
 		 310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  55.08 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  59.28 
 
 		 307 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.58 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 306 aa  322  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  55.8 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  49.28 
 
 		 335 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 319 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  54.04 
 
 		 330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  51.46 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  54.31 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 309 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  51.88 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  50.81 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  48.09 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 		 312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 		 316 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 		 316 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 316 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  47.45 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  51.43 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  54.05 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  52.41 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 		 315 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 338 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  51.85 
 
 		 306 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  52.46 
 
 		 304 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.26 
 
 		 305 aa  299  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  53.07 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 		 303 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  53.01 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  51.3 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  45.19 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.4 
 
 		 309 aa  291  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  50.97 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.24 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 308 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  45.86 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>