More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0246 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
298 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  64.75 
 
 
300 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  63.97 
 
 
300 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  64.98 
 
 
304 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  63.64 
 
 
300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  56.42 
 
 
303 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 
302 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  56.76 
 
 
303 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  54.73 
 
 
303 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  54 
 
 
305 aa  342  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.69 
 
 
305 aa  341  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  52.53 
 
 
303 aa  339  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  52.86 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.97 
 
 
309 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 
312 aa  328  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
304 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
300 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.79 
 
 
315 aa  314  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
300 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
309 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 
309 aa  310  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
355 aa  310  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  310  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
309 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
306 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  54.3 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  51.86 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
298 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.64 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
307 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  51.86 
 
 
305 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 
305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
312 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
306 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 
305 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
318 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  48.64 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
312 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 
306 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
314 aa  301  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  48.3 
 
 
318 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 
304 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
305 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
305 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  47.46 
 
 
302 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
312 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
306 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 
307 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
305 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
301 aa  295  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
309 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
308 aa  295  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 
296 aa  295  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.54 
 
 
303 aa  295  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.44 
 
 
303 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 
303 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
305 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
306 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
306 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
302 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
306 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
309 aa  292  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
305 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
305 aa  291  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
305 aa  291  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
320 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
312 aa  291  8e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
309 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
304 aa  290  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  47.64 
 
 
311 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
311 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
311 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
312 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
308 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
312 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 
320 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
310 aa  288  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  48.14 
 
 
309 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
312 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  48.14 
 
 
309 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 
329 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
313 aa  287  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
331 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
311 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 
313 aa  285  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 
308 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  47.12 
 
 
302 aa  285  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
313 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 
323 aa  285  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>