More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0926 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
318 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1482  ornithine carbamoyltransferase  87.11 
 
 
318 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.278648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  79.25 
 
 
318 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  64.82 
 
 
318 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  65 
 
 
318 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  65.26 
 
 
318 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
308 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  57.24 
 
 
308 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  56.49 
 
 
308 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14241  ornithine carbamoyltransferase  56.48 
 
 
308 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.256907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
306 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 
306 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
309 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  57.89 
 
 
305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
306 aa  353  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 
309 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
304 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  54.4 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 
312 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 
305 aa  316  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
313 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
315 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  51.86 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
303 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
300 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  52.61 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  51.61 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  47.51 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
303 aa  301  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  53.57 
 
 
317 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
338 aa  299  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
305 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
355 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
320 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
340 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 
317 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
307 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
301 aa  296  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
313 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
305 aa  296  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
309 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
308 aa  295  6e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
311 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  295  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
303 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
302 aa  293  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
305 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
304 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
311 aa  292  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
317 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
300 aa  292  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  53.05 
 
 
312 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
303 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
298 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
304 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
302 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
315 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  41.83 
 
 
316 aa  289  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  51.76 
 
 
309 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
307 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  287  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
307 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
303 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
312 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 
303 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
307 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  51.12 
 
 
309 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  51.12 
 
 
309 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 
302 aa  285  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
313 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  50.51 
 
 
300 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  50.85 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  44.98 
 
 
311 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
305 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
305 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
305 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
307 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.95 
 
 
305 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
312 aa  280  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
306 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
329 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
309 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
308 aa  279  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  48.81 
 
 
300 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
305 aa  278  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
323 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>