More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4159 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
338 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
323 aa  348  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  53.55 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  54.19 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  52.6 
 
 
309 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  52 
 
 
302 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
302 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
312 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
311 aa  311  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
315 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
309 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
301 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
316 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
316 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
301 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
316 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  47.23 
 
 
316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
340 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
316 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
316 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
301 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
318 aa  299  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
301 aa  299  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 
320 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
301 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
301 aa  298  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
301 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
304 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
317 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
301 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
313 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  47 
 
 
309 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 
316 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
301 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
323 aa  295  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.59 
 
 
305 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
301 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 
312 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
305 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 
316 aa  292  6e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
304 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2810  ornithine carbamoyltransferase  48.56 
 
 
313 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
317 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  45.02 
 
 
312 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
311 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
306 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
311 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
305 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  45.91 
 
 
318 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  46.01 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
313 aa  282  7.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
303 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 
309 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
355 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  46.13 
 
 
312 aa  281  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  42.72 
 
 
309 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
307 aa  279  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
307 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
307 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
307 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
307 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
312 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  45.98 
 
 
309 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  43.65 
 
 
305 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
313 aa  275  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 
312 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
303 aa  275  9e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  42.49 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  44.69 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2946  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.72 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  45.58 
 
 
318 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  43.71 
 
 
306 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1482  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.278648  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
319 aa  272  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
307 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 
307 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1814  ornithine carbamoyltransferase  43.69 
 
 
312 aa  272  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>