More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0394 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
312 aa  631  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 
305 aa  328  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
303 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.62 
 
 
303 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 
303 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
305 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
303 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
303 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 
309 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  49.02 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.19 
 
 
309 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  48.08 
 
 
321 aa  299  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
314 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
301 aa  291  7e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
303 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
306 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
304 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
298 aa  289  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
300 aa  287  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
318 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
305 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
300 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
303 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
298 aa  285  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  47.4 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 
355 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  48.52 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 
312 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
306 aa  281  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
305 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
306 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.89 
 
 
302 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  44.7 
 
 
301 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
309 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  48.38 
 
 
307 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  44.23 
 
 
310 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  45.21 
 
 
315 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
312 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 
306 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 
309 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 
300 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
304 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
309 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
305 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 
305 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
312 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
302 aa  275  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  46.01 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  43.91 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
306 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.96 
 
 
307 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  45.6 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  44.84 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.94 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  45.61 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
318 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
304 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
306 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
309 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
309 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
309 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
306 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
318 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
329 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
305 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
306 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  44.04 
 
 
305 aa  269  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
309 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
305 aa  268  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  44.88 
 
 
313 aa  268  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  43.31 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 
311 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 
309 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
309 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
308 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  43.87 
 
 
560 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>