More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1899 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  84.67 
 
 		 300 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  80.13 
 
 		 300 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  63.64 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  63.21 
 
 		 304 aa  384  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  53.36 
 
 		 303 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  53.02 
 
 		 303 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 		 309 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  54.41 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  54.04 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.67 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.82 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  47.65 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  47.65 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.33 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 306 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 320 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  45.15 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  46.8 
 
 		 303 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 312 aa  281  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 		 309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  46.67 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  45.64 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 		 302 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  46.33 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  45.48 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  47.14 
 
 		 296 aa  279  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  43.81 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  47.99 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  48.81 
 
 		 318 aa  278  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  43.19 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  47.16 
 
 		 318 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  45.95 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  46.26 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>