More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1345 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
312 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  65.55 
 
 
301 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  64 
 
 
303 aa  407  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 
304 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  64.55 
 
 
300 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 
304 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  61.95 
 
 
303 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 
305 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
302 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  62.67 
 
 
304 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 
300 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 
306 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
305 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 
306 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  60.93 
 
 
298 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
306 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  61.2 
 
 
307 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  61.2 
 
 
306 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  57.98 
 
 
329 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  59.53 
 
 
308 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  60.2 
 
 
306 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
306 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 
309 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 
306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
305 aa  360  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 
309 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 
305 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  57.19 
 
 
306 aa  354  1e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
309 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
309 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
560 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
309 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 
306 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 
311 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 
311 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 
326 aa  349  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  54.85 
 
 
307 aa  348  5e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 
306 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  54.61 
 
 
308 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 
311 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  54.33 
 
 
326 aa  344  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 
308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  54.46 
 
 
309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
308 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
329 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  54.49 
 
 
308 aa  339  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
307 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  54.25 
 
 
310 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  54.3 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
321 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
302 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 
306 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  51.6 
 
 
320 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
305 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
305 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  50.64 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
309 aa  317  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
303 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
303 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
305 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
309 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
305 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
303 aa  305  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
300 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
301 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
303 aa  298  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 
303 aa  298  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
303 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 
316 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
309 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
304 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
309 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
304 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
305 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
312 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 
312 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
302 aa  293  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
309 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
298 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
316 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
330 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>