More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0176 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
304 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  98.03 
 
 
304 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  86.47 
 
 
305 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  84.39 
 
 
303 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  77.52 
 
 
312 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  76.51 
 
 
312 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  76.51 
 
 
312 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  73.58 
 
 
302 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  65.67 
 
 
310 aa  434  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  65.68 
 
 
309 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  66.12 
 
 
328 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  64.8 
 
 
316 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  65.02 
 
 
308 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  64.38 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  62.83 
 
 
314 aa  401  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  64.12 
 
 
308 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  61.67 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  62.5 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  62.91 
 
 
317 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  64.36 
 
 
326 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 
316 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 
319 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 
316 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 
330 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  60.6 
 
 
313 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
308 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  61.87 
 
 
308 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  60.66 
 
 
308 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
308 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  59.48 
 
 
308 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
328 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 
308 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 
308 aa  362  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 
331 aa  354  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 
309 aa  345  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  56.31 
 
 
311 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  54.72 
 
 
311 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  55.05 
 
 
307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  52.77 
 
 
298 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
302 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
311 aa  314  9e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
311 aa  314  9e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.62 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
316 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
316 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
316 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  55.67 
 
 
306 aa  308  9e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  52.01 
 
 
304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
316 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
355 aa  301  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.36 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
304 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
303 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  48.16 
 
 
316 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
315 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  299  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
314 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
307 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 
306 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
312 aa  297  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
304 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  48.51 
 
 
306 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
306 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  48 
 
 
303 aa  295  5e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  295  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
316 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.89 
 
 
306 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
305 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  49 
 
 
309 aa  293  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
306 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
306 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  48.99 
 
 
306 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
300 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
323 aa  292  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
313 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.86 
 
 
308 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
308 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
312 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 
303 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
317 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.81 
 
 
305 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>