More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1599 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
312 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  78.21 
 
 
312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  62.87 
 
 
314 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  61.24 
 
 
309 aa  394  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  61.39 
 
 
306 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 
316 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 
316 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  60.84 
 
 
316 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 
316 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  60.52 
 
 
316 aa  391  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  59.55 
 
 
316 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
316 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 
316 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
316 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
315 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  59.87 
 
 
316 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
320 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 
316 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 
307 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  55.87 
 
 
355 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  58.08 
 
 
305 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  59.48 
 
 
312 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 
313 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
302 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 
303 aa  352  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 
309 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
309 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  54.97 
 
 
308 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
301 aa  345  4e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 
340 aa  345  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
305 aa  342  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
313 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 
302 aa  341  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
303 aa  341  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 
323 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  55.37 
 
 
317 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
300 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  55.02 
 
 
305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 
305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 
298 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  55.88 
 
 
317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  53.07 
 
 
313 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
323 aa  335  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 
312 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 
321 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  52.51 
 
 
304 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 
312 aa  332  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  56.15 
 
 
312 aa  332  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
305 aa  332  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
302 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
312 aa  330  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 
304 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  53.51 
 
 
303 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
303 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
305 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
305 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 
306 aa  328  5.0000000000000004e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 
306 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
303 aa  328  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  53.57 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  53.5 
 
 
314 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 
301 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 
306 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  51.14 
 
 
312 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
306 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  51.66 
 
 
306 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
304 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  52.27 
 
 
306 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
302 aa  322  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
304 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
306 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50.84 
 
 
306 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
304 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  51.91 
 
 
314 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 
311 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  53.67 
 
 
311 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
306 aa  318  6e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
313 aa  318  9e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
308 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  52.73 
 
 
318 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
316 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
313 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.23 
 
 
311 aa  315  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  49.04 
 
 
338 aa  315  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
334 aa  315  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>