More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2130 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
305 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  65 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
306 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  63.67 
 
 
306 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  64 
 
 
305 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  64.33 
 
 
306 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  63.33 
 
 
306 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  62.67 
 
 
301 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  63.67 
 
 
305 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  63 
 
 
306 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  60.07 
 
 
303 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  61.26 
 
 
304 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  60.66 
 
 
306 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  58.67 
 
 
302 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  60.33 
 
 
308 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 
303 aa  384  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 
305 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  61.79 
 
 
311 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 
307 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  61.79 
 
 
311 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 
304 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  61 
 
 
298 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 
300 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  60.87 
 
 
300 aa  377  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 
312 aa  360  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  57.67 
 
 
304 aa  358  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  52.98 
 
 
309 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
306 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 
329 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
307 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
309 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
307 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
321 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 
309 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
560 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 
309 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
326 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 
309 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
305 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
329 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
308 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
326 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 
305 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
308 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
308 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  53.14 
 
 
312 aa  322  5e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  49.36 
 
 
320 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 
303 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
309 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
302 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
305 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
305 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.64 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  48.72 
 
 
320 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
310 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  53.82 
 
 
309 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
312 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
303 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  48.18 
 
 
316 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
316 aa  299  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
316 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
316 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
316 aa  299  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
316 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
304 aa  298  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
316 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0382  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
308 aa  295  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.539911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
316 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
316 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
316 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  47.67 
 
 
298 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
355 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
312 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0885  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 
305 aa  293  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00577741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>